宁夏医科大学和北方民族大学是宁夏自治区三所“大学”之一，在宁夏自治区内知名度极高，毕竟两所学校相对宁夏自治区内的“双非”高校而言，实力都比较强，影响力也相对比较大。两所学校的区别在于，宁夏医科大学是专类高校，而北方民族大学则是一所综合性大学。
北方民族大学建校比较短，改革开放之后才成立，确实是新兴高校，但是背靠大树好乘凉。这所学校的隶属单位是国家民族事务委员会，典型的中央部属高校，所以发展速度极快。这所学校目前设有24个教学学院，开设72个本科专业，不仅仅在传统文理方面基础教深，在理工科方面，如机电、材料、电气、土木、化工等方面，也有极佳的配置，属于多学科并进的综合性大学。
宁夏医科大学，是宁夏老牌高校，建校早，积淀深厚，建有本硕博三级教研体系，尤其是临床医学、基础医学、公共卫生等方面实力突出，在地方病、脊柱结核、生殖遗传、颅脑疾病方面实力较强，这些也是宁夏医科大学“招牌”所在。宁夏医科大学相对全国医学高校来讲，并不是一二线强校，但是在西北地区实力也比较强，尤其是宁夏地区，绝对是医学类高校中第一学府，基础教研方面实力深厚，毕竟是一所老牌高校。
从规模上来看，北方民族大学涉猎的学科和开设的专业，都要比宁夏医科大学更有优势，但是在单项优势方面来看，宁夏医科大学占据的优势更为明显，毕竟宁夏医科大学具有三个学科的博士授予权，而北方民族大学只有一个民族学的博士点，所以单项优势宁夏医科大学更具实力。总体来看，两所学校各具优势，不过从各自擅长领域的知名度和影响力来看，宁夏医科大学更占优势一些。